Galaxy-Workflow-16S_rRNA_Analysis_valide.ga

Sur cette page vous trouverez toutes nos productions et informations téléchargeables, les documents sont répertoriés par rubriques.

 

Un petit livre à ne pas rater, je vous le recommande, en préface Françoise Nyssen, Ministre de la Culture et Frédérique Vidal, Ministre de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

Informations générales:

• Notre bilan 2018 programme 2019
• Notre projet FEDER 3S
• Notre catalogue de formations en collaboration avec VWR
• Notre catalogue de kits

Ateliers

• Liste des ateliers proposés par l’école de l’ADN

Un outil incontournable de laboratoire en biologie moléculaire:

Support d’enseignements

• Article sur CRISPR/Cas à télécharger paru dans le Magazine Salles Propres n°112
• Séquences de TP pour CRISPR/Cas9
• lien Dropbox de téléchargement de séquences NGS pour un workshop sur Galaxy  https://usegalaxy.org/
• Un document de support pour vos librairies NGS sur plate-forme Illumina, par par New England Biolabs (NEB)
• plasmides
• Séquences pour de la Phylogénie avec MEGAX
• Exercice PCR pour AT ou AT PDF et la sequence PCR
• NGS NANOPORE 2024

Accès à Initiation du CQ avec Galaxy

• Echantillons NGS en FTP

• Séquences TP1 GALAXY

https://zenodo.org/record/61771/files/GSM461178_untreat_paired_subset_1.fastq

https://zenodo.org/record/61771/files/GSM461178_untreat_paired_subset_2.fastq

• Séquences TP2 GALAXY

  https://zenodo.org/record/1324070/files/wt_H3K4me3_read1.fastq.gz
  https://zenodo.org/record/1324070/files/wt_H3K4me3_read2.fastq.gz
  

• Séquences TP3 GALAXY

https://www.ecole-adn.fr/uploads/2018/04/sample1-f.fq_.gz

https://www.ecole-adn.fr/uploads/2018/04/sample1-r.fq_.gz

https://www.ecole-adn.fr/uploads/2018/04/sample2-f.fq_.gz

https://www.ecole-adn.fr/uploads/2018/04/sample2-r.fq_.gz

• Séquences de TP GALAXY: RNAseq

• Séquences de TP GALAXY: Nanopore

• https://www.dropbox.com/s/583rz0jrync3vfr/DATA%20NANOPORE%2016S.zip?dl=0

• DATA 2
• 16S WF
• WF16S

• https://www.dropbox.com/s/zgz9sksga5oyo7p/NANOPORE%202.zip?dl=0

  • CS DATA rhizosphere racines.fastq

  • CS DATA total tiges.fastq

  • CS DATA total racines.fastq

  • CS DATA rhizosphere tiges.fastq

  • FAR87726_pass_1f854330_170.fastq
  • FAR87726_pass_1f854330_872.fastq

• Diaporama pour l’exploitation des résultats avec les Kits: DT-03, DT-07 et DT-08
• Support de cours sur la PCR
• Les registres EU des OGM
• Les bonnes pratiques en laboratoire de biologie moléculaire
• Un très bon support pour le clonage par New England Biolabs (NEB)
• PLasmides
• Animation sur la PCR réalisée par Biomédia de l’UPMC – Université Pierre et Marie Curie

                                      LA PCR “animée”

 

Téléchargement spécifiques

• Documents de formations professionnelles
• Evaluation CEMEA
• Qizz CEMEA
• Evaluation après le formation
• sujet BIOTIN 2020